|
|
一、酵母单杂验原理
酵母单杂交技术是由酵母双杂交GAL4系统衍生而来，可以现在酵母细胞内分析与鉴定转录因子是否与DNA顺式作用元件相互结合以及验证互作位点。简单来说，将一段已知特定序列的顺式元件构建到比较基本启动子（minimalpromoter,Pmin）的上游，在Pmin下游连接报告基因，构成包含targetDNAElement(baitsequence)的诱饵DNA。将转录因子构建到可以表达AD激活结构域的载体上，表达形成融合猎物蛋白（prey）。如果转录因子和顺式作用元件存在相互作用，便会激活Pmin，从而促使报告基因得到表达。因此，可以通过检测报告基因表达与否来判断顺式作用元件与转录因子是否发生互作。
酵母单杂原理图
二、酵母单杂常见系统
常用的酵母单杂系统有Y1Hgold（pABAi+pGADT7pGADT7-REC），Y18（pHis2+pGADT7pGADT7-REC），EGY48（pLacZi+pB42AD）。种单杂体系未发现有明显的劣之分。者的区别如下：
1）pAbAi-Bait（DNA）+pGADT7rec或者pGADT7；Y1HGold菌株。插入目的DNA的pAbAi载体需要线性化后转到Y1HGold菌株，制成Bait菌株；筛选标记AbA；
2）pHIS2-Bait（DNA）+pGADT7；Y187菌株。Bait不需要整合到酵母基因组，不需要线性化；筛选标记His+3-AT。
3）pLacZi-Bait（DNA）+pB42AD；EGY48菌株。Bait载体需要线性化整合到酵母基因组；筛选标记X-gal。
、酵母单杂验流程（以Y1HGold为例）
1）载体：
pGADT7（连接转录因子）
pGAbAi（连接启动子）
2）宿主：Y1HGold
3）培养基：SD-Ura、SD-Ura+不同浓度AbA、SD-Ura-Leu+AbA
4）验步骤：
（1）将转录因子构建至pGADT7载体命为AD-prey，将启动子构建至载体pGAbAi命为AbAi-bait
（2）将构建好的AbAi-bait质粒进行BstbI酶切线性化，以便整合到酵母染色体上，随后后转入Y1HGold感受态细胞中，涂布至SD-Ura营养缺陷型固体培养基，28℃培养2-3天，挑取阳性克隆并进行PCR鉴定。
（3）将（2）中鉴定的阳性克隆培养至OD值为02后点至含有不同浓度（0-1000ngmL）AbA的SD-Ura平板上，再以十倍为梯度稀释3个浓度，以菌液OD为0002的为标准，筛选出可以抑制酵母菌落生长的浓度，即为抑制其自激活的AbA浓度。
（4）将（2）中得到的阳性克隆制备成感受态细胞
（5）将空载pGADT7（对照）和构建好的AD-prey（验）质粒分别转入（4）中制备的感受态细胞，并涂布至SD-Ura-Leu+AbA（AbA浓度为（3）中抑制启动子自激活的浓度）固体培养基上
（6）观察菌落在28℃培养条件下的生长情况，如果对照组不生长而验组生长，则说明转录因子与启动子之间存在相互作用。
四、酵母单杂应用举例
酵母单杂主要应用于DNA和蛋白质（多为转录因子）的相互作用研究方面：
①鉴定DNA-蛋白质之间是否存在相互作用
②筛选结合于顺式作用元件上的新基因
③验证已经证的具有相互作用的DNA结合蛋白的DNA结合结构域，以及准确定位与DNA结合的核苷酸序列。
aPromoterstructureoftheSLR1geneReddotsindicatetheW-boxesW1,2andW3indicatethetestedregionsbYeastone-hybridassaysshowingOsWRKY36bindingtothepromoterofSLR1EmptypPB42ADwasusedasnegativecontrolSLR1-1containsW1,2andSLR1-2containsW3asindicatedinfgurea
JieLan等人利用酵母单杂，对水稻的SLR1启动子的W-box进行截取，验证了WRKY36基因与SLR1基因的结合位点。
ThedirectbindingofAmMYB24toMYBCOREATCYCB1checkedbyY1H
AmMYB24RegulatesFloralTerpenoidBiosynthesisInducedbyBlueLightinSnapdragonFlowers这篇文章中作者利用酵母单杂验证了金鱼草MYB24转录因子与OCS启动子的结合位点。
如此，我相信噬菌体展示在未来必定大有可为，创造属于行业的奇迹。泰克生物为客户提供基于M13噬菌体抗体展示系统的高亲和力、高特异性的抗体药物前期发现技术服务，为客户后续的CAR-T/CAR-NK先导序列设计、抗体人源化、药物靶点抗体开发、双特异性抗体开发以及高效阻断型中和抗体开发等下游研发工作提供有力支持。https://www.tekbiotech.com/
|
|
发表于 